Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Swt1Q9DBQ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Swt1Q9DBQ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms