Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBI0

Tmprss6, Transmembrane protease serine 6, mousemouse

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss6Q9DBI0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmprss6Q9DBI0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmprss6Q9DBI0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms