Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim23Q9DAL0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim23Q9DAL0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms