Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlirpQ9D8T7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms