Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cmtm5Q9D6G9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cmtm5Q9D6G9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cmtm5Q9D6G9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms