Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc9bQ9D6E4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms