Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms