Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcc1Q9D4H2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gcc1Q9D4H2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms