Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D2Q3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D2Q3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms