Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc8Q9D2H8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc8Q9D2H8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms