Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pramef12Q9D2F1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pramef12Q9D2F1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms