Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdca7Q9D0M2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdca7Q9D0M2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdca7Q9D0M2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdca7Q9D0M2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdca7Q9D0M2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms