Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Setd6Q9CWY3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Setd6Q9CWY3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms