Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkrip1Q9CWV6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms