Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sycp2Q9CUU3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms