Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fcf1Q9CTH6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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