Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rer1Q9CQU3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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