Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms