Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700129C05RikQ9CQ77 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700129C05RikQ9CQ77 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms