Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd2Q9CQ48 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms