Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrbp1Q99PL5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrbp1Q99PL5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rrbp1Q99PL5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms