Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NsmfQ99NF2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms