Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf17Q99MV7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms