Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nus1Q99LJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nus1Q99LJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms