Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TriobpQ99KW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms