Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms