Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dok4Q99KE3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms