Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctu1Q99J10 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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