Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prss28Q924N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms