Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b5Q923D4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b5Q923D4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms