Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b3Q921M3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b3Q921M3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms