Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med28Q920D3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms