Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q91WD4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q91WD4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WD4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WD4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q91WD4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q91WD4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q91WD4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q91WD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q91WD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q91WD4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q91WD4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q91WD4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q91WD4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms