Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Setd3Q91WC0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Setd3Q91WC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms