Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp3Q91W36 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp3Q91W36 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms