Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Crb1Q8VHS2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Crb1Q8VHS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms