Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc71Q8VEG0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc71Q8VEG0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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