Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpcsQ8VDG5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpcsQ8VDG5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms