Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d2Q8VD57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d2Q8VD57 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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