Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms