Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mterf3Q8R3J4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms