Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Vrk3Q8K3G5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Vrk3Q8K3G5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vrk3Q8K3G5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Vrk3Q8K3G5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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