Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk5rap2Q8K389 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms