Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prpf39Q8K2Z2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prpf39Q8K2Z2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms