Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stn1Q8K2X3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stn1Q8K2X3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms