Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Paf1Q8K2T8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paf1Q8K2T8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms