Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc12Q8K2L8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc12Q8K2L8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms