Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms