Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Nek9Q8K1R7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek9Q8K1R7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Nek9Q8K1R7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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