Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700001C19RikQ8K168 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700001C19RikQ8K168 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms